苎麻基因组微卫星的分离与鉴定

• 作者: 佘玮 周建林 揭雨成 蒋彦波 邢虎成
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud] 微卫星 磁珠 基因组文库 Gan重复序列
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 158-162
• 页数: 5页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2007.01.027

摘要

以苎麻[Boehmeria nivea (L.) Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经MseⅠ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得了双链目的片段,回收300～1 000 bp DNA片段,然后克隆到pMD18-T载体上,转化至DH5α中,这样就构建了苎麻富含(GA)n微卫星的部分基因组文库.随机挑取36个克隆,以锚定简单重复序列为引物对其进行PCR筛选.测序分析了22个阳性克隆,每个克隆都含有微卫星DNA,阳性克隆率为61.1%,微卫星种类以与探针互补的(GA/CT)n为主,占83.3%,同时还存在(TG/AC)n和三碱基、六碱基为单元构成的苎麻微卫星,如(GAC)n、(ACG)n、(TCT)n、(TCG)n、(GAA)n、(CCGACG)n、(GAGAAA)n等.最后以18个微卫星位点设计了18对苎麻微卫星特异引物.GA/CT重复单元的长度从7到40范围内变化,平均为19.2,显示了它们将产生良好多态性,为一种强有力的遗传标记.苎麻微卫星DNA标记可广泛应用于苎麻基因型鉴定,基因和QTL分析,分子标记辅助育种,系谱分析等.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	揭雨成	中国农业科学院麻类研究所	24	446	12.0	21.0
2	周建林	湖南师范大学生命科学院生物化学与分子生物学系	19	249	9.0	15.0
3	佘玮	中国农业科学院麻类研究所	6	40	3.0	6.0
4	邢虎成	中国农业科学院麻类研究所	7	50	3.0	7.0
5	蒋彦波	中国农业科学院麻类研究所	3	88	3.0	3.0