不同构象状态HIV-1 gp120分子运动特征及构象转换能力研究

• 作者: 刘次全 柳树群 符云新
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 化学
• 关键词: HIV-1 gp120 同源模建 构象转换 本质动力学 本质亚空间重叠
• 年，卷（期）: 2007,（21）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 2494-2506
• 页数: 13页
• 分类号: O6
• 字数: 13462字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074x.2007.21.007

摘要

人类免疫缺陷病毒HIV-1包被蛋白gp120通过与宿主细胞表面受体CD4和辅助受体CCR5/CXCR4发生相互作用而侵染细胞.CD4结合状态的HIV-1 gp120核心与CD4结合前状态的SIVgp120核心结构已经被X射线晶体衍射技术所测定.但是,静态的晶体结构不足以阐明gp120动态结构特征及其构象转化能力.用同源模建技术构建不同功能状态的gp120结构模型并用CONCOORD模拟方法生成它们的结构装配体,最后利用本质动力学算法提取、分析前4个本征向量所描述的分子运动特征.结果表明,gp120的主要运动模式表现为内部结构域、外部结构域、桥片层以及V3环之间的旋转/扭曲、绕曲/关闭、延长/压缩运动或这些运动方式的组合,这些运动模式与受体结合以及HIV-1病毒免疫耐受性有关.进一步利用本质亚空间重叠算法评估gp120不同构象间的相互转换能力,结果表明,CD4结合前状态(unliganded)gp120向复合物状态(CD4-complexed)转化的能力强于向移除CD4复合物状态(CD4-free)转化的能力,而CD4-free gp120比CD4-complexed gp120具有更强的向结合前状态转化的能力.本研究揭示了gp120动态结构与功能的关系,并为抗HIV药物设计提供了参考和帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘次全	云南大学现代生物中心	27	97	6.0	8.0
2	柳树群	云南大学生物资源保护与利用重点实验室	2	3	1.0	1.0