288株猪圆环病毒的序列比较及遗传进化分析

• 作者: 冯建远 刘海鹏 尹业师 王爱德 谢丽华 陈琼 黄伟坚
• 来源期刊: 实验动物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒 遗传进化树 同源性比较
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究·论著
• 页码范围: 93-99
• 页数: 7页
• 分类号: S851.34+7
• 字数: 5874字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6179.2007.06.024

摘要

目的 为进一步了解猪圆环病毒(Porcine circovirus,PCV)的遗传进化规律,为该病的预防和控制奠定基础.方法 对来自世界各国的26株PCV1和262株PCV2的全序列用生物软件进行了核苷酸的同源性比较,并对其ORF1和ORF2进行了核苷酸和推导氨基酸的比较.结果 从核苷酸水平来看,PCV1与PCV2明显分为两支,PCV1间分布没有规律,而PCV2间又分为以来自美国、加拿大、澳大利亚的序列为代表的亚型Ⅰ和以来自法国和新西兰的序列为代表的亚型Ⅱ;但从氨基酸水平来看,其分型并没有规律可循.从遗传进化树可以看出,PCV2的分布并没有地域性和时限性.数据统计显示,尽管相隔近十年之久,但其同源性并没有发生太大的改变,可见PCV2相当保守.另外对PCV2的碱基和氨基酸突变位点进行统计发现,PCV2序列间更倾向于碱基的颠换,但并无单个碱基和氨基酸的偏好性.结论 PCV2相对保守,地域性和时限性分布不明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄伟坚	广西大学动物科技学院	72	351	11.0	15.0
2	王爱德	广西大学动物科技学院	40	710	14.0	26.0
3	谢丽华	广西大学动物科技学院	7	51	3.0	7.0
4	冯建远	广西大学动物科技学院	7	67	5.0	7.0
5	陈琼	广西大学动物科技学院	10	54	5.0	7.0
6	尹业师	广西大学动物科技学院	10	73	5.0	8.0
7	刘海鹏	广西大学动物科技学院	5	44	3.0	5.0