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球毛壳菌cox5基因克隆及特性分析
球毛壳菌cox5基因克隆及特性分析
作者:
刘志华
杨谦
胡珅
原文服务方:
东北林业大学学报
cox5
球毛壳菌
基因克隆
特性分析
生物信息学
摘要:
利用BlastX将球毛壳菌(Chaetomium globosum)ESTs序列与GenBank的Nr数据库进行相似性搜索,获得含有细胞色素c氧化酶亚基5基因(cox5)全长cDNA序列的EST(BP099084),以此设计引物.以球毛壳菌总RNA反转录产物为模板进行PCR扩增,获得球毛壳菌cox5的cDNA序列.cDNA全长685 bp,编码169个氨基酸的多肽,蛋白质分子量18.3 KD.蛋白质家族预测其属于cox4家族.球毛壳菌cox5是具有导肽的跨线粒体内膜的蛋白质.BlastP相似性分析表明cox5氨基酸序列保守性不高,与其相似性最高的是柄孢霉的cox5(Podosporaanserina,CAB76570),相似性为75%.cox5基因的cDNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank上登录(登录号分别为DQ082750、AAY85812).
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文献信息
篇名
球毛壳菌cox5基因克隆及特性分析
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
cox5
球毛壳菌
基因克隆
特性分析
生物信息学
年,卷(期)
2007,(4)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
36-40
页数
5页
分类号
Q933
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-5382.2007.04.013
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
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1
杨谦
191
3458
29.0
49.0
2
刘志华
9
68
3.0
8.0
3
胡珅
1
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节点文献
cox5
球毛壳菌
基因克隆
特性分析
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
0
总被引数(次)
68015
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
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