油菜EST-SSR标记的建立

• 作者: 崔海瑞 张明龙 李小白
• 来源期刊: 分子细胞生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 油菜 EST SSR信息 标记建立
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 137-144
• 页数: 8页
• 分类号: S6
• 字数: 4529字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1673-520X.2007.02.007

摘要

在油菜17987条非冗余EST中,共发掘出了2083个EST-SSR,分布于2443条EST中,发生频率是13.58%,平均分布距离为4.34 kb.在油菜EST-SSR中,二、三核苷酸重复是主要的重复类型,二者出现的频率相近,占总SSR的89.05%.AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的84.31%和37.71%.进一步设计了23对SSR引物,通过梯度PCR试验确定了各引物的适宜退火温度,并利用非变性聚丙烯酰胺凝胶银染对这些引物在10个油菜品种中的扩增情况和多态性进行了检测.有21对引物显示扩增,引物可用率为91.30%;有12对引物显现出多态性,占可扩增引物的57.14%.本研究结果证明根据油菜EST建立SSR标记是有效、可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李小白	浙江大学原子核农业科学研究所	7	271	6.0	7.0
2	张明龙	浙江大学原子核农业科学研究所	20	445	11.0	20.0
3	崔海瑞	浙江大学原子核农业科学研究所	61	2119	27.0	45.0