HLA新等位基因B*5618的序列分析

• 作者: 周丹 李桢 熊文 程良红 邵超鹏 邹红岩 金士正
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人类白细胞抗原 等位基因 测序 外显子
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 510-513
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 4001字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn:1003-9406.2007.05.005

摘要

目的 识别确认中国汉族人群中的HLA新等位基因.方法 采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)方法、聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-sequence specific primer,PCR-SSP)方法以及基因测序分型(sequence-based typing,SBT)技术,发现1个与HLA-B*5610等位基因相近的未知等位基因.以基因特异性引物单独扩增B*56基因并对第2、3、4外显子进行双向测序,序列经BLAST验证并分析该基因与B*5610基因的核苷酸序列差异.结果 该基因为新的等位基因,其序列已被GenBank接受(编号为EF016753).新等位基因与最接近的B*5610相比,在第3外显子上有4个核苷酸的不同,即第379位C→G(密码子127 CTG→GTG,氨基酸127Leu→Val);第412位A→G(密码子138AAC→GAC,氨基酸138Asn→Asp);第419位T→C、第420位A→C(密码子140TTA→TCC,氨基酸140Leu→Ser).结论 该等位基因为新的HLA-B等位基因,2006年9月已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*5618.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹红岩	深圳市血液中心输血医学研究所	49	152	6.0	9.0
2	李桢	深圳市血液中心输血医学研究所	43	170	6.0	11.0
3	邵超鹏	深圳市血液中心输血医学研究所	38	452	12.0	20.0
4	程良红	深圳市血液中心输血医学研究所	30	142	6.0	10.0
5	金士正	深圳市血液中心输血医学研究所	17	101	5.0	9.0
6	周丹	深圳市血液中心输血医学研究所	22	246	8.0	15.0
7	熊文	深圳市血液中心输血医学研究所	56	477	11.0	20.0