rRNA二级结构序列用于真菌系统学研究的方法初探

• 作者: 刘超洋 庄文颖
• 来源期刊: 菌物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 子囊菌门 亚结构类型 结构序列 系统演化信号
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-31
• 页数: 10页
• 分类号: Q94
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6472.2007.01.005

摘要

本文首次利用核酸二级结构特征代替核酸碱基作为探讨类群之间亲缘关系的信号,构建了基于结构特征的子囊菌部分类群的系统进化树.该方法以S(规范的碱基对),Q(不规范的碱基对),I(单链),B(侧环),M(多分枝环)和H(发卡结构)为代码将二级结构特征区分为6种不同的亚结构类型,然后将二级结构特征转换为结构序列,并进行结构序列分析.该方法使rRNA不只局限于碱基比较,拓展了其应用范围,为揭示分子的功能与进化的关系提供了线索.结果表明,结构序列分析可用于子囊菌的系统学研究;相对于核酸序列分析,结构分析的结果似乎更加清晰地体现子囊果的演化过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	庄文颖	中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室	80	430	12.0	17.0
2	刘超洋	中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室	3	13	2.0	3.0