中国部分地方黄牛品种线粒体D-loop区的遗传变异与进化分析

• 作者: 姚茹 张桂香 王志刚 贾善刚 陈宏 雷初朝 韩旭
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 起源 进化 黄牛 D-loop 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 510-518
• 页数: 9页
• 分类号: Q95
• 字数: 832字
• 语种: 中文

摘要

测定了13个黄牛品种125个个体的线粒体D-loop区段的全序列,包括12个中国地方黄牛品种的123个个体和德国黄牛2个个体,并进行了分析.结果显示,共检测到93个变异位点,57个单倍型,平均核苷酸差异(average number of nucleotide differences,κ)为22.708,核苷酸多样度(nucleotide diversity,π)为0.0251±0.00479,单倍型多样度(haplotype diversiyt,Hd)为0.888±0.026,表明我国黄牛品种遗传多样性非常丰富.构建的Neighbor-Joining进化树显示这13个品种主要分成两大类型:普通牛和瘤牛;新发现的特殊类型Ⅲ只有一个西藏阿沛甲咂牛的个体,它与牦牛D-loop序列最相近,证明西藏地区的黄牛与牦牛之间存在基因渗入现象.普通牛和瘤牛在日喀则驼峰牛中占的比例分别是64.3%和35.7%,在阿沛甲咂牛中占的比例分别是50.0%和50.0%,证明了西藏的黄牛也有瘤牛类型.云南牛品种的单倍型非常丰富证明了云南在中国黄牛起源上的重要地位;在27个中国黄牛品种中(本研究11个品种以及GenBank上的16个品种)找到了中国瘤牛的核心单倍型i1,并且对它进行了讨论.同时证明了西藏瘤牛独立于中国瘤牛核心类群的特殊性.