基于核磁共振的代谢组学数据预处理

• 作者: 李学军 杨叔禹 温锦波 肖娴 董继扬 陈忠
• 来源期刊: 厦门大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 代谢组学 预处理 归一化 变量选择
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 783-787
• 页数: 5页
• 分类号: R445.2
• 字数: 4376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0438-0479.2007.06.010

摘要

数据归一化是预处理中的重要组成部分,本文采用正常大鼠与I型糖尿病模型大鼠的尿液核磁共振谱图作为测试数据,研究了线归一、面归一和模归一3种数据预处理方法对代谢组学数据PCA分析结果的影响.分析结果表明,面归一预处理方法能够更好地在PC得分图上将对照组和糖尿病组的样本分开.此外,为了有选择性的去除代谢组学数据组中的噪声变量,本文引入新的参数R来评估PC得分图的分类效果,并把它引入适应度函数,设计相应的遗传算法,对代谢组学数据进行变量选择.经过变量选择后,主成分得分图上不同类别样本的可分性提高了,而且变量数大大地减少,更有利于特征代谢物的标记与识别.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈忠	厦门大学物理学系	112	918	18.0	25.0
2	董继扬	厦门大学物理学系	13	72	4.0	8.0
3	李学军		5	45	3.0	5.0
4	杨叔禹		4	44	3.0	4.0
5	肖娴	厦门大学物理学系	2	22	2.0	2.0
6	温锦波	厦门大学物理学系	1	19	1.0	1.0