犬瘟热疫苗株CDV3核蛋白基因全序列测序及分析

• 作者: 张海玲 柴秀丽 王凤雪 罗国良 赵建军 邵西群 闫喜军
• 来源期刊: 特产研究
• 学科: 农学
• 关键词: 犬瘟热病毒 N基因 序列分析 同源性
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 7-10
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65+5
• 字数: 2098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4721.2007.04.003

摘要

根据GenBank 上发表的犬瘟热病毒(CDV)核蛋白(N)蛋白基因序列,设计合成了1对寡聚核苷酸引物,提取犬瘟热病毒疫苗株CDV3的RNA为模板.采用RT-PCR扩增病毒的N蛋白基因,并进行产物克隆和序列分析.将CDV3疫苗株N基因与GenBank数据库中的疫苗株Onderstepoort及中国、美国和德国等分离的疫苗株或毒株共14株CDV N基因序列进行同源性分析,发现CDV3N基因序列与疫苗株Onderstepoort的同源性为97.1%,与其他分离毒株的核苷酸同源性为92.8%～94.0%,其中与中国分离的TN株同源性为93.6%;然而,CDV3N蛋白与它们的氨基酸同源性却基本都为96.6%～97.3%.这说明虽然犬瘟热弱毒株CDV3在核苷酸水平上与其他疫苗株毒株的差异较大,但是在氨基酸水平上的比较差异较小.