南方鲇Hsc70 cDNA的克隆及序列分析

• 作者: 单红 周国勤 张其中
• 来源期刊: 上海水产大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 南方鲇 Hsc70 序列对比 基因结构
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 页码范围: 310-316
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 字数: 4007字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-7271.2007.04.002

摘要

采用RT-PCR法和SMART RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术从南方鲇肝脏RNA克隆获得Hsc70基因的全长cDNA(scHsc70 cDNA).此cDNA全长2384 bp,其中,5'非编码区194 bp,3'非编码区249 bp,编码区域(coding sequence,CDS)长度为1941 bp.根据编码序列推导出相应的646个氨基酸,与其他脊椎动物Hsc70序列进行同源性比较,发现南方鲇Hsc70与欧洲银鲫(Carassius auratus gibelio)、鲦鱼(Pimephales promelas)、人(Homo sapien)和鸡(Gallus gallus)的Hsc70相似性分别为96.0%、95.5%、94.9%和93.8%,表现出较高的保守性.序列分析发现scHsc70 cDNA编码的氨基酸序列中含有2个HSP70家族的特征模体并具有Dnak特征性基序(DLGTY-S-V).南方鲇Hsc70基因的克隆为进一步深入研究南方鲇抗逆机理以及指导南方鲇的遗传选育和遗传改良都具有重要的理论意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周国勤		51	363	11.0	18.0
2	单红		7	47	4.0	6.0
4	张其中	西南大学生命科学学院	58	636	15.0	22.0