一种基于GO分子功能信息的序列编码辅助预测亚细胞定位方法

• 作者: 孙之荣 张松 沈金城
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 亚细胞定位 GO分子功能 氨基酸对组成 支持向量机
• 年，卷（期）: 2007,（13）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1536-1541
• 页数: 6页
• 分类号: Q2
• 字数: 6455字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2007.13.009

摘要

亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关. 本研究提出了一种新的编码方式, 试图根据那些与亚细胞定位相关的蛋白质分子功能信息, 结合氨基酸二肽组成以提高亚细胞定位预测的性能. 结果显示, 在使用支持向量机和RH数据集的测试中, 该方法的预测精度有了显著的提高, 同时对于蛋白质序列N端的不准确性也具有一定的鲁棒性.