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摘要:
采用CTAB法提取总DNA,应用PCR产物直接测序法,测定了山药原植物薯蓣及其近缘种共10个种和1个变种的trnL-F和rbcL序列.序列分析结果表明:薯蓣及其近缘种trnL-F序列长689~834 bp,当空位始终作缺失处理时,有变异位点67个,其中信息位点11个,占序列总长度的1.43%;种间碱基差异百分率为1.6%,其中转换率为0.6%,颠换率为1.0%;序列的G+C含量为32.5%.薯蓣及其近缘种rbcL序列长1 096~1 160 bp,存在变异位点42个,其中信息位点10个,占序列总长度的0.93%;种间碱基差异百分率为0.6%,其中转换率为0.3%,颠换率为0.3%;序列G+C含量为44.1%.基于2个序列分别重建了薯蓣及其近缘种的系统发育树.结果表明2个系统树的结构基本一致,均支持经典分类方法对薯蓣及其近缘种的亲缘关系的划分.同时,本研究也证实叶绿体基因组序列测定是鉴定山药原植物薯蓣及其近缘种的快速、可靠、有效的方法.
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文献信息
篇名 山药原植物薯蓣及其近缘种的分子鉴别和亲缘关系研究
来源期刊 南京农业大学学报 学科 医学
关键词 薯蓣 trnL-F rbcL 分子鉴别 亲缘关系
年,卷(期) 2007,(2) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 55-59
页数 5页 分类号 R282.5
字数 3831字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:1000-2030.2007.02.011
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郑玉红 南京农业大学生命科学学院 3 74 3.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
薯蓣
trnL-F
rbcL
分子鉴别
亲缘关系
研究起点
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相关学者/机构
期刊影响力
南京农业大学学报
双月刊
1000-2030
32-1148/S
大16开
南京市卫岗1号
28-53
1956
chi
出版文献量(篇)
2940
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5
总被引数(次)
46407
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