利用基因芯片数据挖掘宫颈癌相关基因的EST片段

• 作者: 商涛 廖之君 郑文岭 陈数珍 马文丽
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 基因芯片 宫颈癌 差异表达 GEO EST
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1800-1803
• 页数: 4页
• 分类号: R113
• 字数: 3504字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-6273.2007.12.012

摘要

目的:利用基因芯片数据,探讨宫颈癌在分子水平上的发病机制,挖掘肿瘤相关基因EST片段,探索恶性肿瘤标志物,为肿瘤防治找到新的有效手段.方法:从基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)中获得GSM99077基因芯片数据,利用该数据筛选出宫颈癌相关基因的EST片段;然后通过NCBI中的在线BLAST软件找到与之相匹配的同源序列,对这些同源序列进行生物学功能分析,找到与肿瘤的相关性.结果:共发现宫颈癌组织与正常宫颈组织差异表达EST共127条,其中上调的106条,下调的11条,这些差异表达EST的同源序列的转录产物参与转录、翻译、细胞增殖分裂及细胞信号传导等过程.结论:基因芯片能有效、高通量地获取生物内在信息,通过对基因芯片数据再挖掘,可发现宫颈癌的发生涉及多个基因共同作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
2	郑文岭	南方医科大学基因工程研究所	121	603	11.0	20.0
6	廖之君	南方医科大学基因工程研究所	10	33	4.0	5.0
7	陈数珍	南方医科大学基因工程研究所	3	11	2.0	3.0
8	商涛	南方医科大学基因工程研究所	7	15	3.0	3.0