长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5.8S的二级结构分析研究

• 作者: 乔才元 朱国萍 阚显照 高卉
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 二级结构 长苞铁杉 核rRNA 内转录间隔区 5.8 S rRNA 假基因
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 327-333
• 页数: 7页
• 分类号: Q349.55|Q949.66
• 字数: 3456字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2007.03.014

摘要

核糖体RNA及相邻区域的二级结构研究,作为一个重要的工具,已在一些分类等级上被应用于系统发育的分析.以长苞铁杉为实验材料,通过克隆、测序,利用最小自由能原理预测nrDNA内转录间隔区及5.8s转录本的二级结构,分析它们的结构特点,探讨假基因化拷贝与功能拷贝结构上的差异.分析结果表明:(1)ITS1区的二级结构主要由几个延展的发夹结构组成,配对的亚重复单位在松科植物特有的保守序列处有部分重叠,未配对的亚重复单位通常能自身折叠,保守序列的部分碱基出现在发夹结构的环中;(2)假基因化拷贝二级结构的自由能比正常拷贝高;(3)与正常拷贝的二级结构相比,假基因化拷贝在进化速率很低的5.8S功能区发生较大的变异,且在5.8 S末端没有和26 S连接配对.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阚显照	中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室	37	272	9.0	14.0
4	高卉	中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室	2	10	1.0	2.0
8	乔才元	中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室	2	14	2.0	2.0