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摘要:
利用生物信息学和实验验证的技术路线,以拟南芥脱氢抗坏血酸还原酶基因cDNA序列为信息探针,对大豆EST数据库进行同源搜索,经同源性比对和序列组装,获得全长为955bp的大豆脱氢抗坏血酸还原酶基因的cDNA序列(GenBank登录号为DQ006810),经RT-PCR扩增,分子克隆和序列分析验证,结果表明与电子克隆完全一致.该cDNA序列具有完整的开放阅读框架(ORF,36bp-815bp),推测编码蛋白为259个氨基酸.通过与几种植物脱氢抗坏血酸还原酶蛋白序列的比较,发现该基因具有较高的保守性.结果表明根据物种问同源基因序列,对跨物种问EST数据库进行同源检索筛选,拼接,是新基因克隆的一条有效途径.
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文献信息
篇名 大豆脱氢抗坏血酸还原酶基因的电子克隆及进化分析
来源期刊 大豆科学 学科 农学
关键词 大豆 电子克隆 RT-PCR 脱氢抗坏血酸还原酶(DHAR) EST
年,卷(期) 2007,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 45-50
页数 6页 分类号 S565.1
字数 3440字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-9841.2007.01.011
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 胡英考 首都师范大学生命科学学院 41 609 15.0 23.0
2 李雅轩 首都师范大学生命科学学院 43 499 14.0 20.0
3 蔡民华 首都师范大学生命科学学院 31 341 11.0 17.0
4 李蕊 首都师范大学生命科学学院 7 78 4.0 7.0
5 李晓晓 首都师范大学生命科学学院 5 43 3.0 5.0
传播情况
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
大豆
电子克隆
RT-PCR
脱氢抗坏血酸还原酶(DHAR)
EST
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
大豆科学
双月刊
1000-9841
23-1227/S
大16开
哈尔滨市南岗区学府路368号
14-95
1982
chi
出版文献量(篇)
3361
总下载数(次)
6
总被引数(次)
32053
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