军曹鱼淋巴囊肿病毒的系统关系研究及基因型分析

• 作者: 吴淑勤 吴谡琦 孙修勤 张进兴 曲凌云 洪旭光 郑凤荣 闫秀英
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 虹彩病毒 淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-rc) 系统关系 基因型
• 年，卷（期）: 2007,（10）
• 所属期刊栏目: 资源环境与生物技术
• 页码范围: 1087-1091
• 页数: 5页
• 分类号: S9
• 字数: 4484字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2007.10.019

摘要

从患淋巴囊肿病的养殖军曹鱼肿瘤中分离到一种虹彩病毒,命名为淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-rc).为探讨LCDV-rc的系统地位,从DNA水平上分析了该病毒株与淋巴囊肿病毒中国牙鲆分离株(LCDV-cn)、淋巴囊肿病毒韩国鲈鱼分离株(LCDV-sb)、淋巴囊肿病毒日本牙鲆分离株(LCDV-jf)、淋巴囊肿病毒欧洲分离株(LCDV-1)和淋巴囊肿病毒日本岩鱼分离株(LCDV-rf)的系统关系.以核衣壳蛋白(MCP)基因为分子标记,通过PCR扩增和克隆测序获得了长度为1356bp的含178个信息位点的mcp基因序列;用最大简约法、最大似然法、邻接法和Bayesian法构建了分子系统树并进行了置信度检验.结果表明,构建的淋巴囊肿病毒ML、NJ、MP和Bayesian系统树的拓扑结构一致,LCDV-rc和LCDV-sb聚为一支,LCDV-cn和LCDV-jf聚为一支,LCDV-1和LCDV-rf分别各为一支.在35种虹彩病毒的系统关系分析中,LCDV-rc与另5株淋巴囊肿病毒在系统树上聚为一大支,说明LCDV-rc与淋巴囊肿病毒的关系近于其他虹彩病毒.根据遗传距离和系统关系分析认为,LCDV-rc属于一种新的基因型,称其为淋巴囊肿病毒Ⅳ型基因型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴淑勤	中国水产科学院珠江水产研究所	121	1516	22.0	31.0
2	洪旭光		22	544	11.0	22.0
3	孙修勤		61	915	17.0	28.0
4	张进兴		30	567	12.0	23.0
5	曲凌云		29	311	10.0	16.0
6	吴谡琦		9	215	4.0	9.0
7	郑凤荣		2	4	1.0	2.0
8	闫秀英	中国海洋大学生命科学与技术学部	2	10	2.0	2.0