鸡传染性支气管炎病毒河南分离株S1基因克隆及遗传变异分析

• 作者: 崔保安 张书松 方忠意 李新生 赵丽 陈红英 魏战勇
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 传染性支气管炎病毒 S1基因 克隆 遗传变异
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医学
• 页码范围: 295-299
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3294字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2340.2007.03.012

摘要

根据GenBank中已发表的传染性支气管炎病毒(IBV)S1基因,设计并合成了1对引物,采用RT-PCR技术扩增鸡传染性支气管炎病毒河南分离株(HN0501)S1基因,并进行克隆和测序.结果表明,所克隆的片段大小为1 739 bp,包含S1基因和部分S2基因,S蛋白切割识别位点序列为RRSRR.序列比较分析发现,IBV HN0501株S1基因与澳大利亚N1株、吉林JAAS株S1基因核苷酸同源性分别为99.6%,99.8%,氨基酸同源性均为99.3%.而与其它支气管炎病毒株核苷酸同源性为66.4%～85.2%.通过IBV S1基因系统进化分析,结果发现HN0501株与N1株、JAAS株的亲缘关系近,而与其它支气管炎病毒株的亲缘关系均较远.进一步证实IBVHN0501株为IBV肾型株.