长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究

• 作者: 乔才元 朱国萍 杨福生 阚显照
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 长苞铁杉 核rDNA 假基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 208-215
• 页数: 8页
• 分类号: Q349.55|Q949.66
• 字数: 4981字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2007.02.016

摘要

NrDNA作为一个重要的工具,在许多分类等级上被广泛地应用于系统发育的分析.以长苞铁杉(Nothotsuga longibracteata)为实验材料,通过nrDNA ITS区特异拷贝的克隆及假基因化分析,在序列水平上探讨假基因化的特征,进而探讨引起多拷贝基因家族假基因化的分子机制.实验结果表明:假基因化拷贝的序列长度为1 745 bp,比其它拷贝短11 bp～12 bp;GC含量明显偏低,特别是5.8 S区和ITS2区的GC含量分别比其它克隆低6.15 %～6.17 %和5.75 %～6.15 %;5.8 S区和ITS2区序列变异大,遗传距离(d)分别为0.0718+0.0221和0.0691+0.0178;在系统发育的分析中出现异常的长枝现象.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱国萍	安徽师范大学生命科学学院生物大分子进化重点实验室	38	407	11.0	19.0
2	阚显照	中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室	37	272	9.0	14.0
6	乔才元	中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室	2	14	2.0	2.0
7	杨福生	中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室	3	30	3.0	3.0