拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析

• 作者: 李文均 杨玲玲 职晓阳
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟诺卡氏菌属 系统发育分析 16S rRNA基因 看家基因
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 分类和进化
• 页码范围: 951-955
• 页数: 5页
• 分类号: Q939
• 字数: 3612字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2007.06.002

摘要

为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建.研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度.比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致.因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李文均	云南大学微生物研究所	27	800	15.0	27.0
2	职晓阳	云南大学微生物研究所	5	93	4.0	5.0
3	杨玲玲	云南大学微生物研究所	5	58	3.0	5.0