基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台的构建及应用

• 作者: 刘稳升 吕志跃 吴忠道 胡斐 袁衡新 郑焕钦
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 日本血吸虫 基因组 序列分析系统
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 信息研究
• 页码范围: 348-352
• 页数: 5页
• 分类号: R383.2
• 字数: 3449字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1672-3554.2007.03.025

摘要

[目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台.[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合.[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等.[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴忠道	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	171	835	14.0	21.0
2	吕志跃	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	14	67	5.0	8.0
3	刘稳升	中山大学中山医学院生物医学工程系	3	14	2.0	3.0
4	郑焕钦	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	25	151	7.0	11.0
5	胡斐	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	1	1	1.0	1.0
6	袁衡新	中山大学中山医学院生物医学工程系	22	83	6.0	7.0