罗非鱼海豚链球菌16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析

• 作者: 余晓丽 徐增辉 李莉萍 梁万文 甘西 陈明 陈汉忠 雷爱莹 黄维义
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 罗非鱼 海豚链球菌 16SrRNA 克隆 系统发育进化树
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 页码范围: 618-623
• 页数: 6页
• 分类号: S917
• 字数: 4077字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2007.05.008

摘要

为了从分子水平上对1株致病性罗非鱼链球菌进行分类学鉴定,利用原核生物16S rRNA基因通用引物对分离纯化的罗非鱼致病性链球菌进行16S rRNA基因的克隆及序列分析.结果扩增出长约1.5 kp目的片段,测序得到1条长度为1 447 bp核苷酸序列.核苷酸相似性分析表明,序列与NCBI公布的海豚链球菌(Streptococcus iniae,S.iniae)SCCF5L菌株16S rRNA基因核苷酸序列相似性最高(99.4%),暂称为中国广西株(S.iniae-CGX).同时,亲源关系较近的S.iniae、S.difficilis和S.agalactiae代表菌株构建的系统发育进化树显示,所得菌株与S.iniae代表菌株组成同一进化分支,与S.agalactiae代表菌株组成的另一进化分支距离较近(95.5%),而与S.difficilis代表菌株组成的进化分支距离较远(92.3%).上述研究证实,本试验从发病罗非鱼脑组织分离到的致病性链球菌为海豚链球菌.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李莉萍		20	303	9.0	17.0
2	梁万文		36	392	11.0	18.0
3	陈明		26	280	9.0	16.0
4	余晓丽		28	249	9.0	15.0
5	雷爱莹		37	436	13.0	19.0
6	陈汉忠	广西大学动物科学技术学院	55	652	13.0	23.0
7	徐增辉	广西大学动物科学技术学院	9	199	7.0	9.0
8	甘西		52	550	13.0	22.0
9	黄维义	广西大学动物科学技术学院	117	736	14.0	20.0