HLA-B*2736等位基因的序列分析

• 作者: 唐斯 李桢 王大明 程良红 邵超鹏 邹红岩
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 人类白细胞抗原 基因 序列 外显子 内含子
• 年，卷（期）: 2007,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1367-1372
• 页数: 6页
• 分类号: Q3
• 字数: 3584字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2007.11.013

摘要

使用FLOW-SSO、PCR-SSP以及测序等分型技术,发现一个与HLA-B*270401基因相关的未知基因.设计基因特异性引物单独扩增B*27基因的外显子2-5,包括内含子2-4,并进行双向测序,分析与B*270401基因序列的差异.该基因的扩增产物为1815 bp.与B*270401相比在外显子3和4共有10个碱基的改变,从而使相应氨基酸发生错义或同义突变.碱基634 A→C(密码子130丝氨酸→精氨酸);670 A→T(密码子142苏氨酸→丝氨酸);683 G→T(密码子146色氨酸→亮氨酸);698A→T(密码子151谷氨酸→缬氨酸);774 G→c(密码子176谷氨酸→天冬氨酸);776 C→A(密码子177苏氨酸→赖氨酸);781 C→G(密码子179谷氨酰胺→谷氨酸):789G→T(密码子181丙氨酸同义突变);1 438 C→T(密码子206甘氨酸同义突变);1 449 G→C(密码子210甘氨酸→丙氨酸).在IMGT/HLA数据库中B*27组只有3个基因(B*270502/2706/2732)提交了内含子序列.该未知基因的内含子2序列与 B*2706相同,显示了与B*27组基因的同源性,但其同源性在内含子3、4均未得到支持,与B*27组基因相比,内含子3的第106个碱基C→G,碱基168缺失,碱基179 G→A,碱基536 G→A;内含子4中碱基82T→C.但其内含子3、4序列却与B*070201完全相同.该基因序列已提交GenBank,编号为被DQ915176,被WHO确认为HLA-B*2736等位基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵超鹏		12	95	6.0	9.0
2	邹红岩		20	62	5.0	7.0
3	李桢		13	45	3.0	6.0
4	王大明		22	90	5.0	8.0
5	唐斯		4	3	1.0	1.0
6	程良红		11	64	5.0	7.0