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狐貉源犬瘟热病毒核蛋白基因的克隆及序列比较分析
狐貉源犬瘟热病毒核蛋白基因的克隆及序列比较分析
作者:
刘澜澜
华育平
张莉
曾祥伟
原文服务方:
东北林业大学学报
犬瘟热病毒
核蛋白基因
序列分析
摘要:
参照已发表的犬瘟热病毒(CDV)核蛋白基因(N)序列设计合成了1对引物,用RT-PCR方法对从发病狐、貉中分离的MS01、SC01、ZD01三株CDV的N基因进行扩增,并分别将其PCR产物进行克隆和测序.测序结果表明:3病毒分离株N基因阅读框架全长均为1 572 bp,编码523个氨基酸.利用DNAstar的MegAlign生物软件,将3病毒分离株与Genbank数据库中现有的CDV毒株的N基因序列及推导出的氨基酸序列进行了同源性比较和系统进化树分析,结果发现:3病毒分离株与强毒参考株A75/17等野毒株高度同源,核苷酸同源为96.2%~99.1%,氨基酸同源为96.0%~99.8%,而与疫苗株Onderstepoor相对较远,核苷酸同源为93.6%~94.0%.N基因的系统进化关系分析显示:3病毒分离株均归为强毒株,并且与中国新疆的TN株、中国台湾的Kaohsiung株基因型最近,表现出一定的地理位置相关性.
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文献信息
篇名
狐貉源犬瘟热病毒核蛋白基因的克隆及序列比较分析
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
犬瘟热病毒
核蛋白基因
序列分析
年,卷(期)
2007,(9)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
61-63
页数
3页
分类号
S858.92
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-5382.2007.09.023
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
曾祥伟
62
246
8.0
12.0
2
华育平
91
551
12.0
17.0
3
张莉
48
143
5.0
8.0
4
刘澜澜
3
15
3.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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研究主题发展历程
节点文献
犬瘟热病毒
核蛋白基因
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
0
总被引数(次)
68015
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