地方品种固始鸭γ-干扰素基因的克隆与分子进化分析

• 作者: 崔保安 李新生 王东方 胡功政 赵丽 陈红英
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 固始鸭 IFN-γ基因 克隆 进化分析
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 3581字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-7091.2007.03.001

摘要

根据GenBank发表的鸭γ-干扰素cDNA基因序列,自行设计、合成1对引物,应用RT-PCR技术,无需用非特异性免疫原如ConA、PHA等刺激分离的脾淋巴细胞,直接提取总RNA,扩增固始鸭γ-干扰素基因(DuIFN-γ),并进行克隆和测序.测序结果表明,获得了DuIFN-γ全序列,其大小为515 bp,包含一个完整阅读框,编码164个氨基酸残基,推导的氨基酸有3个潜在的N-糖基化位点,有5个与二硫键形成有关的半胱氨酸.序列比较分析发现,克隆的固始鸭IFN-γ基因序列与GenBank中4条鸭IFN-γ基因序列中的3条序列(AF087134,AF100929,AJ012254)完全一致,而与另一条北京鸭核苷酸同源性为99.6%,有2个碱基发生非同义变异,氨基酸同源性为98.8%.固始鸭与人和其他种动物的IFN-γ基因序列分析和系统进化分析表明,IFN-γ基因存在种属的差异性,亲缘关系越近,同源性越高.DuIFN-γ基因的成功克隆为进一步研究固始鸭IFN-γ基因表达、生物学活性和应用奠定基础.