金藻3011和8701与球等鞭金藻的18S rRNA基因研究

• 作者: 杨泽民 章群 谢数涛
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 金藻3011 金藻8701 球等鞭金藻 18S rRNA基因 RNA二级结构
• 年，卷（期）: 2007,（8）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 445-448
• 页数: 4页
• 分类号: S963.1
• 字数: 3345字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1111.2007.08.005

摘要

对金藻3011和8701的18S rRNA基因序列进行测定,分别获得1695 bp和1684 bp的DNA序列.应用DNAMAN,DNAstar和RnaViz 2.0生物软件,将获得的DNA序列与球等鞭金藻的18S rRNA基因序列进行DNA序列和RNA二级结构对比分析.DNA序列分析显示,三者的18S rRNA基因序列非常保守,相似性在99.5%以上,三者应同为球等鞭金藻;RNA二级结构分析显示,三者的RNA二级结构既存在球等鞭金藻种的特异性茎环结构,又存在明显的差异,并且从相近水域(山东)分离出来的3011和8701相对于采自挪威水域的球等鞭金藻具有更大的结构相似性;相对于3011,8701可能与球等鞭金藻具有更高的同源性.由此可见,单纯的18S rRNA基因序列分析可能不适用于球等鞭金藻种下水平的研究,但是其RNA二级结构分析对球等鞭金藻的物种鉴定,甚至是种下地理株的研究都具有非常重要的意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章群	暨南大学水生生物研究所	86	843	17.0	23.0
2	谢数涛	暨南大学水生生物研究所	33	328	10.0	16.0
3	杨泽民	广东药学院生物化学与分子生物学教研室	39	307	10.0	16.0