人肺腺癌细胞系A549细胞双向电泳-飞行时间质谱研究

• 作者: 南岩东 卜丽娜 杨拴盈 田应选 阮禹松 霍树芬
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 人肺腺癌细胞系 蛋白质组学 双向电泳 基质辅助激光解吸离子化电离飞行时间质谱 肽指纹图谱
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 422-426
• 页数: 5页
• 分类号: R734.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8259.2007.04.020

摘要

目的 初步分析人肺腺癌细胞系A549细胞蛋白质表达情况,从蛋白组水平探讨肺腺癌发病的分子机制.方法 应用2-DE技术对人肺腺癌细胞系A549细胞总蛋白进行分离,获得蛋白质表达谱;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)结合生物信息学进行蛋白质鉴定.结果 3块胶平均蛋白斑点数为1 138±49,平均匹配点数为986±32,匹配率为85.8%.随机选取背景清晰、分辨清楚、蛋白含量较高的20个斑点进行MALDI-TOF-MS分析,共获得了18个肽质量指纹图谱(PMF).将PMFs质量数据通过Aldente软件查询SWISS-PROT数据库,根据匹配片段及氨基酸序列覆盖率等,初步鉴定出15种蛋白质.根据功能,这些蛋白质可分为:①基本代谢相关的酶类:果糖2-磷酸醛缩酶、视网醛脱氢酶1(RALDH1)、吡多醛激酶;②细胞骨架类:蛋白细胞角蛋白8(CK8)、β-2链微管蛋白;③应激相关蛋白:蛋白二硫化物异构酶A3(PDIA3);④ 信号转导分子:膜联蛋白1(ANX1)、膜联蛋白4(ANX4);⑤分子伴侣:热休克蛋白60(HSP60)、热休克蛋白β-1、抑制素(PHB);⑥转录及翻译相关蛋白:不均一性核糖核蛋白H(hnRNP H);⑦杂类:Rgr protein、NPM、PCBP1.结论 应用2-DE/MALDI-MS方法获得了较为理想的人肺腺癌细胞系A549细胞2-DE蛋白质表达谱,初步鉴定了15种蛋白质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨拴盈	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	72	472	10.0	19.0
2	田应选	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	24	77	6.0	7.0
3	阮禹松	西安交通大学生命科学与技术学院	11	99	6.0	9.0
4	卜丽娜	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	5	20	3.0	4.0
5	南岩东	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	8	64	6.0	8.0
6	霍树芬	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	2	12	2.0	2.0