大豆根际未培养与培养细菌群落结构差异比较研究

• 作者: 刘居东 刘晓冰 张秋英 徐艳霞 王光华 金剑
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 根际 细菌群落 PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 土壤肥料·植物保护
• 页码范围: 907-913
• 页数: 7页
• 分类号: S154.36
• 字数: 3707字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-9841.2007.06.019

摘要

根际土壤微生物群落结构是根际微生态系统中的重要组成部分,与根际养分有效性、植物生长发育及抗病性等关系密切,不同植物间、同一植物的不同基因型之间根际微生物群落结构差异较大.利用从两种基因型大豆根际土壤中直接提取和从平板培养菌落提取的微生物DNA为模板,采用细菌通用引物GC-357r和517r进行PCR扩增,对PCR产物的DGGE图谱进行聚类和主成分分析.结果表明,不同基因型大豆根际土壤未培养的细菌群落结构差异不大,而在土壤浸提液和NA培养基上形成的可培养的细菌群落结构受培养基种类和接种浓度(10-2和10-3)影响较小,但受不同大豆基因型影响而产生了差异.对DGGE条带进行分析表明,大豆根际未培养的细菌群落物种丰富度(S)和多样性指数(H)明显高于可培养细菌,说明培养过程是一个再选择的过程,在这个过程中一些微生物的信号得到放大,而大量的微生物信息缺失.对主要DGGE条带测序显示,大豆根际有三大类细菌:拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形杆菌门(Proteobacteira)和放线菌门(Actinobacteria).变形杆菌门(Proteobacteira)中的γ-Proteobacteria、α-Proteobacteria和放线菌门(Actinobacteria),在未培养和培养细菌中都表现为优势种群.与培养细菌相比,变形杆菌门中的γ-Protebacteria和拟杆菌门(Bacteroidetes)细菌在可培养细菌中占优势,而在未培养细菌中丰度较低.结果证明,大豆根际细菌经培养后已使原有的群落结构发生改变,影响对原位细菌群落结构的认识.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金剑	中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土生态实验室	66	2222	28.0	46.0
2	王光华	中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土生态实验室	76	3148	33.0	55.0
3	张秋英	中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土生态实验室	43	1439	21.0	37.0
4	刘居东	中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土生态实验室	16	358	9.0	16.0
5	徐艳霞		1	10	1.0	1.0