毛细管电泳与MFOLD软件研究单链脱氧核糖核酸分离二级结构

• 作者: 敖燕 王荣 谢华 贾正平 贾海 陈巧云 马骏
• 来源期刊: 分析化学
• 学科: 化学
• 关键词: 毛细管电泳 单链构象多态性 二级结构预测软件
• 年，卷（期）: 2007,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1347-1350
• 页数: 4页
• 分类号: O6
• 字数: 3412字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-3820.2007.09.023

摘要

从Gene Bank 数据库中下载质粒基因序列,用DNAssist 软件分析并最终建立了单点碱基突变模型,并以此为研究对象对单链DNA分离机理进行研究探讨.采用高效毛细管电泳-激光诱导荧光检测(CE-LIF)方法,以线性聚丙烯酸胺为筛分介质对模型进行分离分析,并与MFOLD软件所预测的单链二级结构进行对照分析.分离条件为:线性聚丙烯酸胺浓度为6%,负极进样,13 kV分离,温度为19℃,λem=488 nm、λex=520 nm.结果发现毛细管电泳实际分析结果有4个单链峰,而MFOLD软件预测的只有3种二级结构,预测的准确度为75%,MFOLD软件虽然有局限性,但预测DNA二级结构仍有一定的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾正平	兰州军区兰州总医院药剂科	265	2369	24.0	39.0
2	谢华	兰州军区兰州总医院药剂科	88	406	11.0	18.0
3	王荣	兰州军区兰州总医院药剂科	99	464	12.0	18.0
4	马骏	兰州军区兰州总医院药剂科	39	194	9.0	13.0
5	贾海	兰州军区兰州总医院药剂科	9	42	5.0	6.0
8	敖燕	兰州军区兰州总医院药剂科	2	14	2.0	2.0
15	陈巧云	兰州军区兰州总医院药剂科	2	25	2.0	2.0