基因指纹法预测鼻咽癌放射敏感性初步研究

• 作者: 冯国生 司勇锋 张政 李瑶 程金建 邓卓霞 郭懿 陈甲信
• 来源期刊: 中国肿瘤临床
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 放射敏感性 基因表达谱 基因指纹
• 年，卷（期）: 2007,（20）
• 所属期刊栏目: 快速报道
• 页码范围: 1141-1145
• 页数: 5页
• 分类号: R73
• 字数: 3805字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-8179.2007.20.001

摘要

目的:研究放射敏感与放射抵抗的鼻咽癌组织基因表达差异,寻找预测鼻咽癌放射敏感性基因指纹.方法:采用BioStarH-141s(2004)型含14112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片,对19例不同放射敏感性鼻咽癌组织进行检测,其中放射敏感8例,放射抵抗11例,用T-test检验、聚类、LOOCV等方法进行生物信息分析.结果:放射抵抗组与放射敏感组比较,表达差异的基因P＜0.5有923条,P＜0.01有164条,P＜0.001有17条;与慢性炎症组织相比,放射敏感组70%以上病例有2倍以上表达差异的基因267条,明显高于放射抵抗组106条.这些基因包括已知的与放射敏感性密切相关的基因PRKD,DCK等;还有大部分以前没有描述与放射敏感性相关的基因,如SIRT1,RABAC1,PPP1CC,ZNF638,APPBP1,RABAC1等,它们主要与细胞周期、S期和M期调控点、细胞凋亡、细胞生长、DNA绑定,RNA绑定等功能有关;还有一些新发现的,功能尚未明确的基因,如CUTA,ZNF148,Sep15,TMTC3,TOP1等.取P＜0.01的差异表达基因98条进行聚类分析,19例患者能分成放射敏感与抵抗二类,除1例外,所有病例敏感性的分类均与临床结果相符.用LOOCV验证,准确率100%.结论:不同放射敏感性的鼻咽癌组织,基因表达存在明显差异,与炎症组织比较,放射敏感组的基因表达差异更大,可利用差异基因簇进行放射敏感性分类,提示可利用基因指纹法进行鼻咽癌放射敏感性预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	司勇锋	广西壮族自治区人民医院鼻咽癌研究所	77	261	8.0	10.0
2	张政	广西壮族自治区人民医院鼻咽癌研究所	34	94	6.0	7.0
3	冯国生	广西壮族自治区人民医院鼻咽癌研究所	44	140	6.0	8.0
4	陈甲信	广西壮族自治区人民医院鼻咽癌研究所	36	212	8.0	12.0
5	李瑶	上海复旦大学生命科学院遗传所遗传工程国家重点实验室	8	14	2.0	3.0
6	程金建	广西壮族自治区人民医院鼻咽癌研究所	14	114	5.0	10.0
7	郭懿	上海复旦大学生命科学院遗传所遗传工程国家重点实验室	1	4	1.0	1.0