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丙型肝炎病毒包膜基因变异与急性丙型肝炎疾病转归的动态研究
丙型肝炎病毒包膜基因变异与急性丙型肝炎疾病转归的动态研究
作者:
王宇明
陈佳
陈嵩
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
丙型肝炎病毒
包膜基因
准种
演化动态
摘要:
目的 探讨HCV包膜基因变异与急性丙型肝炎疾病转归的关系.方法 前瞻性收集到5例HCV急性感染者的系列血清标本,其中2例一过性感染,3例持续性感染.采用高精确度DNA聚合酶,较长PCR扩增HCV基因组结构区(包括C区C端、E1和E2区N端)1 kb产物并进行克隆,每份标本挑选33个克隆,以异源双链和单链构象多态分析筛查的代表性克隆型DNA进行测序,并对HCV的E1、HVR1及HVR1除外的E2区核酸序列的非同义碱基替换率、同义碱基替换率以及氨基酸序列的理化特征进行分析.结果 HCV持续性感染者急性期与慢性期的标本比较,HVR1基因差异性明显大于E1(0.0322±0.0068 vs-0.0020±0.0014,P<0.05)和HVR1以外的E2区(0.0322±0.0068 vs 0.0017±0.0011,P<0.05),而一过性感染者感染初期与病毒清除前标本比较,HVR1、E1和HVR1以外E2基因差异性则无明显改变.HCV持续性感染者的E1(0.23×10-3±0.15×10-3)、HVR1(2.76×10-3±1.51×10-3)和HVR1以外E2区(0.50×10-3±0.10×10-3)的非同义碱基替换率比较,HVR1非同义碱基替换率呈明显增高趋势.相反,一过性感染者E1、HVR1和HVR1以外E2区的同义碱基替换率和非同义碱基替换率则无明显改变.E1、E2区所有半胱氨酸及潜在的糖基化天冬酰胺均高度保守,HVR1第11、25、27位置保持碱性氨基酸.结论 HCV持续感染与宿主免疫反应对HVR1的阳性选择相关,HVR1区特异位置保守的碱性氨基酸可供研制HCV疫苗时参考.
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生物标志物
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期刊文献
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(/次)
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文献信息
篇名
丙型肝炎病毒包膜基因变异与急性丙型肝炎疾病转归的动态研究
来源期刊
中华微生物学和免疫学杂志
学科
医学
关键词
丙型肝炎病毒
包膜基因
准种
演化动态
年,卷(期)
2007,(2)
所属期刊栏目
临床免疫学
研究方向
页码范围
123-128
页数
6页
分类号
R5
字数
3870字
语种
中文
DOI
10.3760/j.issn:0254-5101.2007.02.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王宇明
第三军医大学西南医院全军感染病研究所
299
2460
25.0
35.0
2
陈嵩
第三军医大学西南医院全军感染病研究所
21
122
5.0
10.0
3
陈佳
第三军医大学西南医院全军感染病研究所
19
87
5.0
9.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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1997(1)
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参考文献(3)
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参考文献(2)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
丙型肝炎病毒
包膜基因
准种
演化动态
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0254-5101
CN:
11-2309/R
开本:
大16开
出版地:
北京市经济技术开发区经海二路38号
邮发代号:
2-55
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
5865
总下载数(次)
10
总被引数(次)
26456
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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