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摘要:
目的:通过对江苏启东地区乙型肝炎病毒(HBV)全基因序列的分析,探讨该地区肝癌高发的分子病毒学病因.方法:以蛋白酶K消化后,酚/氯仿抽提7例肝炎和7例肝癌患者血清中DNA.应用聚合酶链反应(PCR),扩增血清中HBV基因全长,克隆至T载体后行全自动测序.以PHYLIP软件构建的系统进化树判断HBV的基因型;以Clastal W软件对序列进行突变分析.结果:14例标本中有12例为C基因型,2例为B基因型.肝癌和肝炎组中HBV基因型类别分布无差异.有5例HBV发生了PreS2的缺失突变,其中肝癌标本4例(57.1%),肝炎标本仅1例(14.3%).HBV基因组中常见的点突变为PreS1区的nt.3116及核心启动子区的nt.1762/1764,发生率高达78.6%(11/14).与肝炎组相比,肝癌中点突变发生率显著增高的位点为前C区nt.1899 G→A的突变(P=0.01)及核心启动子区nt.1653 c→T的突变(P=0.05).结论:启东地区HBV以C基因型为主;启东HBV基因组中可能存在着与肝癌相关的点突变和缺失突变.
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文献信息
篇名 启东肝癌高发区乙肝病毒流行株全基因分析
来源期刊 肿瘤 学科 医学
关键词 肝肿瘤 肝炎,乙型 基因,病毒 点突变
年,卷(期) 2007,(6) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 429-432
页数 4页 分类号 R735.7|R730.231+.3
字数 3688字 语种 中文
DOI 10.3781/j.issn.1000-7431.2007.06.003
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 许丽 上海交通大学肿瘤研究所分子诊断室 11 78 4.0 8.0
2 屠红 上海交通大学肿瘤研究所分子诊断室 12 100 5.0 10.0
3 钱耕荪 上海交通大学肿瘤研究所分子诊断室 5 122 5.0 5.0
4 金晏 上海交通大学肿瘤研究所分子诊断室 2 63 2.0 2.0
5 郭霞 复旦大学公共卫生学院 1 8 1.0 1.0
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肝肿瘤
肝炎,乙型
基因,病毒
点突变
研究起点
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
肿瘤
月刊
1000-7431
31-1372/R
大16开
上海市斜土路2200弄25号
4-289
1981
chi
出版文献量(篇)
4424
总下载数(次)
6
总被引数(次)
33137
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导