时序微阵列数据中的同步和异步共调控基因聚类

• 作者: 印莹 张斌 王国仁 赵宇海
• 来源期刊: 计算机学报
• 学科: 工学
• 关键词: 同步/异步共调控 活化/抑制共调控 聚类 时间序列 基因本体
• 年，卷（期）: 2007,（8）
• 所属期刊栏目: 聚类
• 页码范围: 1302-1314
• 页数: 13页
• 分类号: TP311
• 字数: 10454字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-4164.2007.08.012

摘要

基因的共调控可分为同步和异步两种.文中提出了一种新的聚类模型Reg-Cluster,将具有相同编码的同步和异步共调控基因聚集到同一个共调控基因类中.在此基础上,提出了一种有效的聚类算法FBLD,采用先宽度优先、后深度优先的搜索策略,并结合高效的削减规则,挖掘得到所有符合条件的最大Reg-Cluster.聚类结果中包含了详细而完备的共调控信息,有助于基因调控网的研究.算法可扩展用于三维基因-样本-时间微阵列数据集的分析.FBLD算法已经应用到真实和人造微阵列数据集中,其结果被提交到Gene Ontology,实验结果证明了算法的高效性和有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王国仁	东北大学信息科学与工程学院	228	2804	25.0	45.0
2	张斌	东北大学信息科学与工程学院	203	1801	20.0	33.0
3	印莹	东北大学信息科学与工程学院	26	77	5.0	8.0
4	赵宇海	东北大学信息科学与工程学院	30	40	4.0	5.0