北京地区Noro病毒主要衣壳蛋白编码基因的序列分析

• 作者: 张又 朱汝南 贾立平 赵林清 钱渊 陈冬梅
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Noro病毒 VP1基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 394-399
• 页数: 6页
• 分类号: R3
• 字数: 3983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2007.05.002

摘要

目的 确定从北京地区婴幼儿腹泻标本中检测到的3株Noro病毒的基因型别及主要衣壳蛋白(VP1)编码基因的特点.方法 从经酶免疫分析法筛选到的Noro病毒阳性的粪便标本中应用RT-PCR方法扩增Noro病毒VP1全基因,克隆到pBS-T载体中并测定核苷酸序列,与GenBank中的其他Noro病毒VP1基因序列进行比较和分析.结果 经过扩增和测序,标本CR2905、CR2932和CR2987的VP1基因全长分别为1620 bp、1623 bp和1647 bp,编码不同大小的蛋白.CR2905和CR2932与GⅡ-4型的氨基酸同源性在80%以上,属于Noro病毒GⅡ基因组(Genogroup)的GⅡ-4型(Genotype);CR2987与GⅡ-3型的氨基酸同源性在80%以上,属于Noro病毒GⅡ基因组的GⅡ-3型.CR2905、CR2932与其他GⅡ-4型的变异性在9.1%至12.5%之间,提示为新的变异株.结论 北京地区婴幼儿中存在不同基因型别的Noro病毒的感染,根据基因的同源性分析,CR2905、CR2932可能为GⅡ-4型的新的变异株.