主要过敏原的物种分布及逐步聚类分析

• 作者: 张建国 李扬彬 赖荷 邹泽红 陶爱林 黄柏波
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 主要过敏原 分布 逐步聚类分析 代表性过敏原
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 基础免疫学
• 页码范围: 451-456
• 页数: 6页
• 分类号: R3
• 字数: 5659字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2007.05.017

摘要

目的 综合分析数据库中过敏原的总体状况,在剖析重组过敏原研究领域的共性问题后,对主要过敏原进行聚类分析,为重组过敏原的深入研究指明方向.方法 以国际免疫学联合会过敏原命名分会公布的正式过敏原名录表为原始数据,对过敏原的物种分布特点进行分析,并采用Kolmogorov-Smironov检验对过敏原类型分布与相应的物种分布的一致性进行检验;针对氨基酸序列数据,采用ClustalW 1.83及MEGA2等生物信息学软件,辅之以手动缩减,对来自公共数据库中的主要过敏原进行逐步聚类分析,以获得代表性过敏原.结果 过敏原物种分布分析显示,510个过敏原归属于9大类共179个物种,不同类型过敏原所涉及的物种数及过敏原例数产生的两类分布相同;用关键词在蛋白质数据库中搜索得到的60条主要过敏原序列,聚类成有着明显差异的7个簇后,逐步聚类缩减到21个氨基酸序列无任何相关的代表性过敏原.结论 过敏原的研究是依所涉及的物种不同而逐步平行地展开,没有明显的物种或过敏原的侧重点;依据氨基酸序列的相似性,可以将不同物种来源的主要过敏原缩减到少数代表性过敏原上,从而减少重组过敏原的工作量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陶爱林	广州医学院第二附属医院过敏反应科	14	84	6.0	9.0
2	邹泽红	广州医学院第二附属医院过敏反应科	19	85	6.0	8.0
3	赖荷	广州医学院第二附属医院过敏反应科	39	179	8.0	11.0
4	李扬彬	广州医学院第二附属医院过敏反应科	59	454	12.0	18.0
5	张建国	广州医学院第二附属医院过敏反应科	72	350	11.0	15.0
6	黄柏波	广州医学院第二附属医院过敏反应科	1	9	1.0	1.0