禽传染性支气管炎病毒SAIBk株全基因组的分段克隆、测序及分析

• 作者: 周生 唐梦君 柳萍 王红宁 黄勇
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禽传染性支气管炎病毒 致肾病变型 基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 72-77
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3904字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2007.01.013

摘要

根据GenBank上公布的IBV基因组序列,经多重比较后设计19对引物,用RT-PCR方法对禽传染性支气管炎病毒致肾病变型分离株SAIBk株的全基因组进行了分段扩增、克隆和序列测定.测序结果表明:SAIBk株基因组序列全长27 520 bp,A+T的含量占61.74%,具有典型的冠状病毒基因组结构.基因组内碱基的插入和缺失主要分布在3 220-3 470位、20 560-20 810位、25 310-25 600位和27 150-27 220位.与GenBank上公布的5株IBV基因组序列Beaudette、Mass41、Cal99、BJ、KQ6的同源率分别为87.2%、87.6%、87.2%、85.6%和87.5%.SAIBk株基因组不同区域的同源性分析结果表明,3'UTR和5'UTR是基因组中最为保守的区域,同源率在90.9%～97.7%,而S1基因是基因组中变异最大的区域,同源率在74.8%～83.2%.系统进化分析结果表明SAIBk株与国内分离株S14、LX4、BJ的亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王红宁	四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室	112	1706	21.0	34.0
5	黄勇	四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室	48	395	11.0	18.0
6	周生	四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室	13	89	5.0	9.0
7	唐梦君	四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室	3	36	3.0	3.0
8	柳萍	四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室	21	317	10.0	17.0