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稻瘟病菌新无毒基因AvrPi7的遗传及物理作图
稻瘟病菌新无毒基因AvrPi7的遗传及物理作图
作者:
冯淑杰
林菲
潘庆华
王玲
马俊红
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
Magnaporthe oryzae
无毒基因
高分辨率图谱
部分二倍体
摘要:
稻瘟病是目前最具毁灭性的作物病害之一. 本研究通过由田间菌株CHL346和CHL42杂交得到的189个子囊孢子菌株构建的分离群体, 在亲本菌株CHL346中鉴定到了与水稻稻瘟病抗性基因Pi7对应的无毒基因AvrPi7. 为了确定AvrPi7位点的染色体位置, 本研究开发了一套基于稻瘟病菌测序菌株70-15全基因组序列的121个微卫星(simple sequence repeat, SSR)标记. 利用这些SSR标记对AvrPi7位点进行了连锁分析. 结果表明, 位于第1染色体的8个SSR标记与该无毒基因连锁, 其中2个最近的侧翼标记MS1-9和MS1-15分别距离AvrPi7位点3.2和16.4 cM. 为了进一步完成该位点的精细作图, 在MS1-9和MS1-15的侧翼区域进一步开发了8个SSR标记和3个候选无毒基因(candidate avirulence gene, CAG)标记. 通过对这些标记的连锁分析, AvrPi7位点被界定于标记MS1-21和MS1-22之间1.6 cM的区域内, 并与标记CAG2共分离. 为了构建该无毒位点的物理图谱, 通过生物信息学分析(bioinformation analysis, BIA), 将与该基因连锁的分子标记分别着陆于参考菌株70-15的超重叠群(supcontig)上. AvrPi7位点最终被界定在标记MS1-21和MS1-22之间的75 kb区段内. 本研究的结果对于进一步了解真菌中普遍存在的重组不平衡和部分二倍体等现象, 以及对该基因进行克隆及其功能研究具有重要意义.
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文献信息
篇名
稻瘟病菌新无毒基因AvrPi7的遗传及物理作图
来源期刊
科学通报
学科
农学
关键词
Magnaporthe oryzae
无毒基因
高分辨率图谱
部分二倍体
年,卷(期)
2007,(3)
所属期刊栏目
论文
研究方向
页码范围
283-290
页数
8页
分类号
S4
字数
8640字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0023-074X.2007.03.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王玲
华南农业大学资源环境学院植物抗病遗传学研究室
21
694
11.0
21.0
2
潘庆华
华南农业大学资源环境学院植物抗病遗传学研究室
16
768
14.0
16.0
3
冯淑杰
华南农业大学资源环境学院植物抗病遗传学研究室
22
315
9.0
17.0
7
林菲
华南农业大学资源环境学院植物抗病遗传学研究室
7
226
3.0
7.0
8
马俊红
华南农业大学资源环境学院植物抗病遗传学研究室
1
19
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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引证文献(0)
二级引证文献(4)
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引证文献(1)
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引证文献(1)
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2015(5)
引证文献(1)
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2018(3)
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2019(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
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无毒基因
高分辨率图谱
部分二倍体
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
科学通报
主办单位:
中国科学院国家自然科学基金委员会
出版周期:
旬刊
ISSN:
0023-074X
CN:
11-1784/N
开本:
大16开
出版地:
北京东城区东黄城根北街16号
邮发代号:
80-213
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
11887
总下载数(次)
74
相关基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:
National Basic Research Program of China
官方网址:
http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:
农业
广东省自然科学基金
英文译名:
Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:
http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:
研究团队
学科类型:
期刊文献
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