中国两地旋毛虫分离株COX1序列分析

• 作者: 杨益超 欧阳颐 谢祖英 黎学铭
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 旋毛虫 COX1 分类
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 245-247
• 页数: 3页
• 分类号: R383.15
• 字数: 1278字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-930X.2007.02.029

摘要

目的:分析广西南丹和河南两地旋毛虫分离株COX1序列,鉴定两地旋毛虫的虫种.方法:分别提取2个分离株基因组DNA,PCR扩增COX1片段,并对扩增产物进行T-A克隆测序;应用相关软件分析序列的同源性、遗传距离,同时构建系统发生树,并与GenBank中已知旋毛虫种相应基因序列比较.结果:我国2个旋毛虫分离株和T.spiralis的COX1序列长度相同,为419 bp;南丹和河南分离株与T.spiralis的相似度分别为99.0%和98.8%.南丹与河南分离株之间为99.8%;两地分离株与其它旋毛虫种的相似度低于90.8%.南丹和河南分离株与T.spiralis遗传距离分别为0.005、0.003.两地分离株之间的遗传距离为0.003,与其它旋毛虫的遗传距离均＞0.101.2个系统发生树中,我国2个分离株与T.spiralis 位于同一分支,自引导值分别为100和99.结论:推断广西、河南两地旋毛虫分离株均为T.spiralis.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢祖英	广西壮族自治区疾病预防控制中心蠕虫病防制科	12	52	3.0	7.0
2	黎学铭	广西壮族自治区疾病预防控制中心蠕虫病防制科	57	261	9.0	13.0
3	欧阳颐	广西壮族自治区疾病预防控制中心蠕虫病防制科	31	111	5.0	9.0
4	杨益超	广西壮族自治区疾病预防控制中心蠕虫病防制科	49	233	8.0	13.0