栀子苷、胆酸及其配伍干预脑缺血全基因表达谱的比较研究

• 作者: 张亮 张占军 李澎涛 王忠 王永炎 程京 胡木林 荆志伟 高思华
• 来源期刊: 北京中医药大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 栀子苷 胆酸 组分配伍 脑缺血 基因芯片 层次聚类
• 年，卷（期）: 2007,（7）
• 所属期刊栏目: 科技之窗
• 页码范围: 462-467,插4
• 页数: 7页
• 分类号: R285.5
• 字数: 5194字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1006-2157.2007.07.008

摘要

目的 比较脑缺血后清开灵主要组分栀子苷、胆酸及其配伍对基因表达谱的影响.方法 建立全脑缺血再灌注小鼠模型,分为栀子苷组、胆酸组、栀子苷+胆酸组.一步法抽提小鼠脑组织的总RNA,Cy3/Cy5标记,16 463个小鼠脑oligo片段芯片检测全基因组表达谱,每组重复实验669次.Genespring分析显著变化基因,GO原则分类,层次聚类分析全基因组表达谱信息.结果 栀子苷组、胆酸组、栀子苷+胆酸组所致差异表达基因数分别为95、86、102,其中上调63、48、56个,下调32、38、45个基因,共同调节基因19个.3组差异基因集中在代谢和信号转导相关基因方面.重叠基因数栀子苷+胆酸组与胆酸组(30个)多于栀子苷+胆酸组与栀子苷组(25个),前两者及早反应基因如Pip92表达相似,后两者则在炎症相关因子,如NFкB、Irf5、IL-1β、TNF-α、IL-6、IFN-γ等表达雷同;聚类分析发现栀子苷组表达谱较胆酸组更接近栀子苷+胆酸组;实时定量PCR结果与芯片结果一致.结论 ①虽然栀子苷组、胆酸组与栀子苷+胆酸组存在共同的调节基因,但栀子苷组偏重于对炎症相关因子,特别是对NFкB、Irf5等炎症介导因子的调控;而胆酸组对Pip92等凋亡前功能基因的调节较为突出;②重叠基因数与聚类分析结果的不一致提示基因分析不能仅局限在差异数量上,而应该深入分析基因功能和组分的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王忠	中国中医科学院中医临床基础医学研究所	102	1056	16.0	29.0
2	荆志伟	中国中医科学院中医临床基础医学研究所	70	558	14.0	20.0
3	李澎涛	北京中医药大学基础医学院	159	2564	24.0	44.0
4	张占军	北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室	49	321	9.0	15.0
5	张亮		21	125	6.0	10.0
6	高思华	国家中医药管理局科技司	5	49	4.0	5.0
7	胡木林	中国中医科学院中医临床基础医学研究所	7	22	3.0	4.0
8	程京		9	64	4.0	8.0