黄瓜抗病基因类似序列(RGA)的同源性分析和Southern 鉴定

• 作者: 丁国华 周秀艳 池春玉 秦智伟
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 抗病基因类似序列 同源性 Southern杂交
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 355-360
• 页数: 6页
• 分类号: S642.2
• 字数: 2542字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0513-353X.2007.02.017

摘要

使用Clustal W和DNAMAN 3.0分析了本实验室克隆的15个黄瓜抗病基因类似序列(RGA)之间以及与烟草的N基因、亚麻的L6基因和拟南芥的RPS2基因之间的同源性,并对这些RGA进行了PCR和Southern验证与分析.结果表明:15个黄瓜RGA中,核苷酸序列同源性最高的是CsRGA2、CsRGA4和CsRGA5,其次是CsRGA6、CsRGA7、CsRGA8和CsRGA4,CsRGA1和CsRGA3也存在较高的同源性;其余的RGA同源性较低.在氨基酸序列上也表现了相同的特征.与N、L6和RPS2等抗病基因的产物之间同源性最高46%,最低22%.根据核苷酸序列设计了15对特异引物,用PCR方法验证了所有黄瓜RGA的存在,其中CsRGA3在黄瓜品种间表现出多态性.利用特异引物PCR方法合成了15个黄瓜RGA的地高辛探针,与EcoRV酶解的黄瓜'215'、'129'和'L18'的基因组DNA进行Southern杂交,证实了各个RGA在基因组上的存在,同时发现,CsRGA9、CsRGA11～CsRGA15都是多拷贝,CsRGA3是单拷贝,其余为双拷贝.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周秀艳	东北农业大学园艺学院	111	1188	17.0	28.0
2	秦智伟	东北农业大学园艺学院	170	2065	23.0	34.0
3	丁国华	东北农业大学园艺学院	13	324	12.0	13.0
5	池春玉	哈尔滨师范大学阿城学院	22	263	10.0	16.0