糜子干旱后复水过程中基因表达谱的初步分析

• 作者: 何蓓如 宋国琦 林凡云 胡银岗
• 来源期刊: 西北农林科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 抑制消减杂交(SSH) 糜子 复水 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 农业科学
• 页码范围: 81-86
• 页数: 6页
• 分类号: Q786
• 字数: 4829字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-9387.2007.03.018

摘要

为探索在干旱后复水条件下糜子抗旱种质的基因表达特点,寻找与其复水后快速恢复生长相关的基因,利用抑制消减杂交(Suppressive subtraction hybridization,SSH)技术,以糜子干旱后复水处理叶片的cDNA为tester,干旱胁迫处理叶片的cDNA为driver,构建了一个抑制消减杂交文库.在文库中随机选取100个克隆(插入片段≥250 bp)测序,所获序列去除载体、引物及接头序列后,利用NCBI的BLAST序列比对分析软件分别对GenBank的dbEST数据库和非冗余蛋白数据库进行序列比对分析.序列同源性分析显示,文库中序列的同源基因主要以与新陈代谢、能量代谢、转录、蛋白加工、细胞信号转导及细胞组分生物合成相关的基因为主,其中以新陈代谢及细胞组分生物合成相关的基因数最多,分别占到与已知蛋白同源的EST的22.4%和10.3%.表明植物在干旱后复水条件下产生一系列的信号传导,同时启动相应的转录机制,激活响应基因的表达,以适应逆境的改变.