截形苜蓿吡哆醇生物合成基因的电子克隆和进化分析

• 作者: 孟宪萍 李蕊 李雅轩 胡英考 蔡民华
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 电子克隆 截形苜蓿 吡哆醇 生物合成基因 EST
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 81-84
• 页数: 4页
• 分类号: S503.52
• 字数: 2654字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-1302.2007.01.028

摘要

电子克隆是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的、利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法.根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以拟南芥吡哆醇生物合成蛋白基因(PDX)cDNA序列为探针,在GenBank的HTGs数据库中找到与之高度同源的截形苜蓿的基因组序列--mth2-17p16克隆,通过GenScan软件预测和序列拼接得到了截形苜蓿吡哆醇生物合成基因序列(GenBank登录号为DQ139263).用该序列对GenBank中的est-others进行相似性搜索,获得了25条截形苜蓿的EST序列,经拼接后发现与基因组预测的基因序列一致,表明该基因是真实存在和表达的.该cDNA序列长度为1 257 bp,具有完整的开放式阅读框(ORF 29-973bp),推测编码314个氨基酸.通过对日本百脉根(Lotus corniculatus var.japonicus)、烟草(Nicotiana tabacum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)、小麦(Triticum aestivum)和水稻(Oryza sativa)等进行吡哆醇生物合成蛋白序列同源比较,发现该基因具有高度的保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡英考	首都师范大学生命科学学院	41	609	15.0	23.0
2	李雅轩	首都师范大学生命科学学院	43	499	14.0	20.0
3	蔡民华	首都师范大学生命科学学院	31	341	11.0	17.0
4	李蕊	首都师范大学生命科学学院	7	78	4.0	7.0
5	孟宪萍	首都师范大学生命科学学院	5	40	4.0	5.0