抗HIF-1αmRNA锤头状核酶的计算机设计

• 作者: 岳军 金玉
• 来源期刊: 实验室科学
• 学科: 工学
• 关键词: 锤头状核酶 缺氧诱导因子-1α 基因治疗
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 计算机应用
• 页码范围: 96-98
• 页数: 3页
• 分类号: TP3
• 字数: 2402字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-4305.2007.06.044

摘要

设计一个抗缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA的锤头状核酶为构建它的基因表达载体选择靶点,以便用于肿瘤的基因治疗.从GenBank寻找缺氧诱导因子-1mRNA的全序列,用RNA结构分析软件预测HIF-1αmRNA的二级结构并选择合适的核酶作用靶点,从而设计相应的锤头状核酶.HIF-1αmRNA的577位含有GUC三联体,可以作为核酶的切割靶点,设计的核酶包括22nt的催化活性中心和16nt的侧翼序列.计算机辅助预测证明此位点为合适的靶点,用Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)筛选以确定的靶点序列的唯一性.成功设计抗HIF-1αmRNA锤头状核酶基因表达载体,为进一步运用核酶切割HIF-1αmRNA基因来抑制肿瘤生长铺平了道路.