H5N1血凝素蛋白切割位点的序列研究

• 作者: 周豪魁 姚劲松 朱贻盛 李亦学 石萍 郭晓莉 魏冬青 黄振德
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: H5N1血凝素 切割位点 元胞自动机 特征氨基酸片段 同源模拟
• 年，卷（期）: 2007,（16）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1908-1912
• 页数: 5页
• 分类号: Q5
• 字数: 4362字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074x.2007.16.011

摘要

血凝素(hemagglutinin, HA)能否被切割成HA1和HA2是决定禽流感病毒高致病性的重要因素.分析切割位点的序列, 研究其进化规律可以让我们更深入地了解H5N1的高致病性.本研究先通过元胞自动机的方法将HA的基因序列转化为图形, 并在图上找到了一段H5N1亚型仅有的特征基因片段.这个特征基因片段包含30个碱基, 主要由A和G组成, 其对应的氨基酸主要是带正电荷的碱性氨基酸.这个特征氨基酸片段正好处于HA的酶切位点上.通过3D结构的同源模拟, 发现H5N1 HA蛋白的切割位点较为暴露, 非常有利于各种酶对其进行剪切.本研究还构建了切割位点的分子表面, 以进一步分析可能的氨基酸突变将如何影响表面的电荷分布.结果表明, 某些突变较大地改变了电荷的表面分布, 可能使病毒失去高致病性.H5N1特征氨基酸片段突变情况的统计表明, 在时间上, 2005年突变案例的比例比前几年上升了许多; 而在地域上, 中国大陆的突变病毒案例占了绝大比例.这些结果都有助于我们研究病毒高致病力的进化情况.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏冬青	上海交通大学生命科学技术学院	22	74	5.0	7.0
2	朱贻盛	上海交通大学生命科学技术学院	45	452	12.0	17.0
3	郭晓莉	上海交通大学生命科学技术学院	2	7	2.0	2.0
4	李亦学	上海交通大学生命科学技术学院	6	50	2.0	6.0
5	石萍	上海交通大学生命科学技术学院	4	31	3.0	4.0
6	周豪魁	上海交通大学生命科学技术学院	1	5	1.0	1.0
7	姚劲松	上海交通大学生命科学技术学院	1	5	1.0	1.0
8	黄振德	上海交通大学生命科学技术学院	3	5	1.0	2.0