支持向量机方法预测离子通道蛋白

• 作者: 毕然 涂白
• 来源期刊: 计算机与数字工程
• 学科: 生物学
• 关键词: 离子通道 结构域 支持向量机 基因本体
• 年，卷（期）: 2007,（10）
• 所属期刊栏目: 算法与分析
• 页码范围: 8-10
• 页数: 3页
• 分类号: Q816
• 字数: 3009字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-9722.2007.10.003

摘要

讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白.通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较.通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毕然	华中科技大学生命科学与技术学院	5	61	4.0	5.0
2	涂白	华中科技大学生命科学与技术学院	1	2	1.0	1.0