基于字典的DNA序列压缩算法研究及应用

• 作者: 彭宏 林丕源 林毅申
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 数据压缩 生物信息学 DNA序列数据
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 开发应用
• 页码范围: 265-267
• 页数: 3页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2007.06.087

摘要

在现有DNA序列数据压缩算法的基础上,以DNA序列数据的存储效率及生物学解释综合考虑,设计并实现了基于字典的DNA序列压缩算法DNADCompress.算法核心包括重复子串字典建立、字典项筛选、字串压缩编码三方面.实验数据表明,数据压缩算法压缩效果达到常用DNA序列压缩算法水平,并为序列生物学解释提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭宏	华南理工大学计算机科学与工程学院	188	2058	24.0	34.0
2	林丕源	华南农业大学信息学院	42	267	9.0	13.0
3	林毅申	华南理工大学计算机科学与工程学院	4	49	3.0	4.0