一种基于氨基酸物理化学性质上的DNA序列图形表示及相似性分析

• 作者: 刘法利 赵熙强
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA序列 图形表示 氨基酸 相似性分析 进化树
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 855-860
• 页数: 6页
• 分类号: Q52
• 字数: 3710字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2008.05.023

摘要

基于氨基酸的物理化学性质,将氨基酸分为4类,疏水,带电荷,有极性,甘氨酸,在此基础上给出DNA序列一种新的图形表示方法:将1列DNA序列表示为二维空间中的3条特征曲线,利用计算C(i,j)矩阵的主特征值,给出DNA序列的3维特征向量,得到相似距离矩阵.最后计算10种不同物种β-球蛋白第一段外显子的欧式空间距离矩阵D(i,j),并利用UPGMA算法给出了这10种不同物种基于这种相似关系的系统发生树.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵熙强	中国海洋大学数学系	18	83	4.0	8.0
2	刘法利	中国海洋大学数学系	1	2	1.0	1.0