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企鹅珍珠贝热休克蛋白70基因的克隆与序列比较分析
企鹅珍珠贝热休克蛋白70基因的克隆与序列比较分析
作者:
喻达辉
曲妮妮
李莉好
杜博
童馨
郭奕慧
黄桂菊
原文服务方:
热带海洋学报
企鹅珍珠贝Pteria penguin
热休克蛋白70基因
cDNA克隆
序列比较
摘要:
采用同源克隆和锚定PCR技术,从企鹅珍珠贝Pteria penguin中克隆到热休克蛋白hsp70基因的cDNA全序列.cDNA全长2 308 bp,3'非编码区域(UTR)为234 bp,5'UTR为118 bp,开放阅读框(ORF)为1 956 bp,编码651个氨基酸,分子量为70.97 kd,理论等电点为5.24,有2个糖基化位点:NKSI和NVSA,并含有HSP70家族的3个签名序列:IDLGTTYS,DLGGGTFD和IVLVGGSTRIPKIQK,以及C末端的保守序列EEVD.结合BLAST分析的结果,可以确认获得的cDNA序列为企鹅珍珠贝HSP70的编码序列.与合浦珠母贝Pinctada fucata hsp70的氨基酸序列相比,企鹅珍珠贝多1个糖基化位点NVSA,少1个氨基酸,包括1个氨基酸插入和2个缺失.两者的氨基酸序列一致性高达92%,突变位点52个;两者的核苷酸序列一致性高达79%,突变位点416个.系统发育分析表明两者的亲缘关系最近,与传统分类相符,然后与太平洋牡蛎等聚合在一起.该基因的克隆和比较分析为进一步深入研究珍珠贝类的抗逆机理、抗性育种及其进化具有重要意义.
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文献信息
篇名
企鹅珍珠贝热休克蛋白70基因的克隆与序列比较分析
来源期刊
热带海洋学报
学科
关键词
企鹅珍珠贝Pteria penguin
热休克蛋白70基因
cDNA克隆
序列比较
年,卷(期)
2008,(1)
所属期刊栏目
海洋生物学
研究方向
页码范围
46-51
页数
6页
分类号
Q591.2|Q959.215
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1009-5470.2008.01.009
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
版权信息
全文
全文.pdf
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引文网络
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节点文献
企鹅珍珠贝Pteria penguin
热休克蛋白70基因
cDNA克隆
序列比较
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带海洋学报
主办单位:
中国科学院南海海洋研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1009-5470
CN:
44-1500/P
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1982-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
1766
总下载数(次)
0
总被引数(次)
21069
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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