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摘要:
利用日本DDBJ数据库电子克隆了条斑紫菜的6-磷酸海藻糖合成酶基因(pytps),得到全长cDNA序列2727bp;经过ORFfinder分析,获得了相应蛋白质的全长序列908An,分子量约为101.8kD.将条斑紫菜的6-磷酸海藻糖合成酶与多种模式生物大肠杆茼、裂殖酵母、拟南芥、水稻、秀丽隐杆线虫、黑腹果蝇的同源蛋白进行序列比对得到了聚类分析图表明它们之间具有一定的进化相关性功能结构域预测分析显示PyTPS拥有两个功能结构域Clyco.transf 20 domain和Trehalose.PPase domain,这对于进一步分析蛋白质结构与功能的关系将有很大的启示.
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文献信息
篇名 条斑紫菜6-磷酸海藻糖合成酶基因全长cDNA的电子克隆
来源期刊 生物信息学 学科 生物学
关键词 条斑紫菜 6-磷酸海藻糖合成酶 电子克隆
年,卷(期) 2008,(1) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 6-8
页数 3页 分类号 Q78
字数 3019字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.01.003
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 宣劲松 北京科技大学应用科学学院生物科学与技术系 7 33 4.0 5.0
2 张冰君 北京科技大学应用科学学院生物科学与技术系 1 7 1.0 1.0
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条斑紫菜
6-磷酸海藻糖合成酶
电子克隆
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1672-5565
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2003
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