苏云金芽孢杆菌kurstaki亚种几丁质内切酶基因的生物信息学分析

• 作者: 吴淑华 方继朝 蔡平钟 钟万芳 阎文昭
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苏云金芽孢杆菌 几丁质酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 页码范围: 815-819
• 页数: 5页
• 分类号: Q754
• 字数: 3576字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2008.06.017

摘要

以苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种(Bacillus thuringiensis subsp kurstaki)基因组DNA为模板,利用1对特异性引物通过Touchdown PCR方法扩增了长为 2 576 bp的几丁质酶kchi基因序列(GenBank登录号:AY189740).生物信息学分析发现:该序列包含1个完整的开放阅读框,编码688个氨基酸,推测是分子量约为75 820.等电点pI=5.89的几丁质酶前体.序列和结构比较分析结果表明:Kchi属于几丁质内切酶,包括几丁质酶催化区、粘蛋白Ⅲ型同源区和几丁质结合区3个结构域,在N端还有1个分泌信号肽.除与Bt巴基斯坦亚种几丁质酶同源性较低(相似性为61.3%)外,与Bt其他亚种的同源性都较高(≥92.0%).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡平钟	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	33	250	7.0	14.0
2	阎文昭	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	42	371	11.0	17.0
3	方继朝	江苏省农业科学院植物保护研究所	80	747	15.0	22.0
4	钟万芳	江苏省农业科学院植物保护研究所	18	100	6.0	8.0
5	吴淑华	江苏省农业科学院植物保护研究所	10	203	7.0	10.0